1. (大學部)

  本系設置「生物醫學技術」、「精緻農業管理」等兩大課程；再佐以「健康照護與保健生技學程」，以訓練學生具跨領域及多專長等能力，以利投入職場。

2. 生物醫學技術學程

  結合台灣強大的資訊產業、食品工業、生物醫學等基礎，培育生物科技、生物醫學、醫學檢驗、診斷技術、儀器設備及耗材、食品安全檢測、機能性食品之研發等台灣此刻正發展茁壯之產業所需之人才。設置如「奈米技術及生醫材料」、「應用微生物學」、「生物資訊學」、「幹細胞醫學」、「再生醫學」等課程。

3. 精緻農業管理學程

  台灣農地分割破碎，無法大面積耕作，致作物成本高，發展精緻農業、注重生態環境保育，提高作物價值已為唯一出路。本系以植物生技為本，建構具經濟價值農、畜、禽、魚品種及農業有益、有害微生物與昆蟲之基因體資料庫，再結合本校食藥用菇類研究中心之育種及保健產品的研發。此外，本系亦注重生技產業經營管理及產品行銷人員之培育，使本系同學畢業後，具有一技之長外，也能取得致富之鑰。設置如「食藥用真菌學」、「值物保護概論」、「植物病原微生物檢測技術」、「生技產業行銷管理、」「生技產業品質管理」等課程程。

4. 健康照護與保健營養生技學程(跨領域學程)

  為使本系學生具多專長以符合產業人才所需，使學生能更多元化修讀跨院多系之基礎課程，設置如「中醫藥保健學」、「保健食品概論」、「創新生技產業」、「資料探勘」等課程。