本系大學部課程規劃以兩大學程為主要目標，分別為「生物醫學技術學程」和「應用生物技術學程」希望能夠引發對生命科學領域之興趣，本系課程不但可學到理論基礎並能應用於實務上，使通才教育之外，更能學有專精以成為生物科技之專門人才提供生物產業蓬勃發展所需之人力；研究所課程規劃，以醫藥生物技術核心課程、生物農業技術核心課程。